L'ADN està carregat negativament, per tant, quan s'aplica un corrent elèctric al gel, l'ADN migrarà cap a l'elèctrode carregat positivament. Les cadenes més curtes d'ADN es mouen més ràpidament pel gel que les cadenes més llargues, de manera que els fragments s'organitzen per ordre de mida.
Quins fragments es mouen més ràpidament?
Com que tots els fragments d'ADN tenen la mateixa quantitat de càrrega per massa, fragments petits es mouen pel gel més ràpidament que els grans.
Per què les cadenes més curtes d'ADN es mouen més ràpid?
Segments d'ADN més curts troben més porus pels quals puguin moure's, els segments d'ADN més llargs han de fer més estrènyer i moure's cap amunt o cap avall. Per aquest motiu, els segments d'ADN més curts es mouen pel seu carril a una velocitat més ràpida que els segments d'ADN més llargs.
Per què els fragments d'ADN més curts viatgen més lluny?
[1] Les molècules d'àcid nucleic es separen aplicant un camp elèctric per moure les molècules carregades negativament a través d'una matriu d'agarosa. Les molècules més curtes es mouen més ràpidament i migren més lluny que les més llargues perquè les molècules més curtes migren més fàcilment pels porus del gel.
Per què l'ADN superenrotllat funciona més ràpid?
In vivo, l'ADN plasmídic és un cercle fortament superenrotllat per permetre que encaixi dins de la cèl·lula. … Per tant, per a la mateixa mida general, l'ADN superenrotllat funciona més ràpid que l'ADN circular obert. L'ADN lineal passa primer a través d'un extrem de gel i, per tant, manté menys fricció que l'obert. ADN circular, però més que superenrotllat.