En biologia molecular, STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) és una base de dades biològica i un recurs web d'interaccions proteïna-proteïna conegudes i previstes. … L'última versió 11b conté informació sobre uns 24, 5 milions de proteïnes de més de 5.000 organismes.
Quin és l'objectiu de la base de dades STRING?
La base de dades STRING té com a objectiu recollir i integrar aquesta informació, mitjançant la consolidació de les dades d'associació de proteïnes conegudes i previstes–per a un gran nombre d'organismes.
Què és una puntuació STRING?
A STRING, cada interacció proteïna-proteïna s'anota amb una o més "puntuació". És important destacar que aquestes puntuacions no indiquen la força ni l'especificitat de la interacció. En canvi, són indicadors de confiança, és a dir, la probabilitat que STRING consideri que una interacció és certa, tenint en compte les proves disponibles.
Per què interaccionen les proteïnes?
Les interaccions proteïna-proteïna (IPP) són contactes físics d' alta especificitat establerts entre dues o més molècules de proteïnes com a resultat d'esdeveniments bioquímics dirigits per interaccions que inclouen forces electrostàtiques, hidrogen enllaç i l'efecte hidrofòbic.
Què és l'associació funcional?
definició. Relació binària entre entitats biològiques quan una d'elles modula l' altra en funció de la funció, expressió, degradació o estabilitat de l' altra i la relacióentre els socis no es pot determinar com a directe, de manera que hi ha passos intermedis implícits.