Com que els DdNTP tenen una molècula d'hidrogen (-H) en lloc d'un grup hidroxil (-OH) unit al 3'-C de la seva desoxiribosa, no poden unir-se a cap nucleòtid entrant. Per tant, addició de DdNTP durant la replicació de l'ADN es pot utilitzar per acabar la reacció de síntesi.
Per què s'atura la síntesi d'ADN quan s'incorpora un ddNTP a la cadena d'ADN en creixement?
Si el nucleòtid afegit és un "didesoxinucleòtid" (figura 6.29), l'extrem 3' de la cadena en creixement tindrà ara un H, en lloc d'un OH. Això evitarà que s'afegeixin nucleòtids addicionals; és a dir, la síntesi d'ADN in vitro s'aturarà en aquest punt.
Com acaba un ddNTP la síntesi d'ADN?
Quan s'incorpora un ddNTP a una cadena de nucleòtids, la síntesi s'acaba. Això es deu al fet que la molècula ddNTP no té un grup hidroxil 3', que és necessari per formar un enllaç amb el següent nucleòtid de la cadena.
Per què els DdNTP finalitzen el procés de replicació?
Mètodes de laboratori en enzimologia: DNA
Didesoxinucleòtid trifosfats s'incorporen fàcilment a una cadena d'ADN en creixement, però no tenen el grup hidroxil de 3′ necessari per permetre que la cadena continuïi finalitzar efectivament la polimerització.
Per què els didesoxinucleòtids fan que s'aturi la replicació de l'ADN?
Aquests ddNTP manquen d'un grup 3′-OH necessari per a la formació d'un enllaç fosfodièster entre dosnucleòtids, fent que l'extensió de la cadena d'ADN s'aturi quan s'afegeix un ddNTP.