Arabinosa és un sucre de cinc carbonis que es troba àmpliament a la natura i pot servir com a única font de carboni en molts bacteris. Els productes proteics de tres gens (araB, araA i araD) són necessaris per a la degradació de l'arabinosa en membres de la família Enterobacteriaceae, com E. coli i S.
Què fa l'arabinosa amb els bacteris?
Així, quan hi ha arabinosa per activar l'operó d'arabinosa, es produeix la GFP i els bacteris poden fluoresc. Sense arabinosa, el gen GFP no s'expressa i no hi ha fluorescència. Per tant, variant la composició dels nutrients, un investigador pot controlar quan (i si) es produeix la floració en els bacteris transformats.
Quin és el paper de l'arabinosa en la transformació bacteriana?
Arabinosa actua com a regulador al·lostèric de l'AraC, canviant a quins llocs d'ADN s'uneix i com forma un dímer. Recordeu que l'arabinosa és el sucre que es catabolitza les proteïnes de l'operó AraBAD. Quan s'afegeix arabinosa al medi on viu E. coli, s'uneix fortament a AraC.
Per què s'utilitza arabinosa?
Ús en biologia
En biologia sintètica, l'arabinosa s'utilitza sovint com a un interruptor unidireccional o reversible per a l'expressió de proteïnes sota la Pmalpromotor a E. coli. Aquest interruptor d'encesa es pot anul·lar per la presència de glucosa o invertir-se mitjançant l'addició de glucosa al medi de cultiu, que és una forma de repressió de catabòlits.
Coml'arabinosa afecta la regulació i l'expressió dels gens en bacteris?
Quan hi ha arabinosa, araC relaxa la configuració de l'ADN de manera que es pot produir la transcripció, però quan aquest carbohidrat està absent, la mateixa proteïna limita l'ADN per reduir la seva capacitat d'unir-se amb ARN polimerasa.